根据《城市设计》草案，以国际化视野、前瞻心思维、创造心设计为宗旨开展城市设计国际咨询的翠亨科学城，将构建“两轴、四带、一心、五区”的多元复合结构框架，打造为湾区国际化、现代化、创新型城市新中心。翠亨科学城的高水平规划和高标准建设，也代表了中山中山参与粤港澳大湾区建设的态度与行动。
从规划图可以看到，翠亨科学城的架构主要由“两轴、四带、一心、五区”组成。其中“十字轴”的东西向以客运港为节点，构建一条联通山、海、城、河涌、湿地的东西向创智服务轴；南北向以基地中部的主干道翠城道为依托，构建连接马鞍岛北部的南北扩展轴。
“井字带”依托茅龙水道、海岸、横八涌等水洗形成四条滨水休闲景观带，构建滨海风光带和生态景观走廊道；
“一心”以超级街区和水岸湖湾为特色的，由城市创享中心与城市公共客厅共同构成的城市中心；
“五区”包括了依托客运港形成以合作交流为导向的门户综合服务特区的东部，规划为生态湿地休闲区的西部，定位为创智综合服务区的中部，设计为产业研发单元化布局的科创启动区的北部，以及面向未来和创新的品质生活区的南部。
以创新驱动发展为引领，翠亨科学城在开展城市设计国际咨询过程汇总，提出设计方案注重从强化湾区互动、粤港澳合作、东西两岸融合发展、联动周边区域发展入手，综合考虑与深圳前海、深圳大空港、深圳海洋新城、广州南沙、珠海横琴、东莞滨海湾新区、中山中心城区、中山滨海产业创新带等区域重要节点的关系，统筹考虑区域功能布局、交通组织和配套服务的关系，明确中山翠亨科学城在区域中差异化协同发展的角色，助力中山建设成为珠江东西两岸融合发展的支撑点。
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